Омикс-технологии и интеллектуальный анализ данных

Проект

Молекулярный имиджинг онкологических патологий биологических тканей в терагерцовой области спектра с использованием лазерной спектроскопии с разрешением по времени, технологий анализа больших данных и машинного обучения. Проект РФФИ. Соглашение № 17-00-00186 от 31.10.2017. Руководитель — Кистенев Ю.В.

Цель проекта:

Проведение исследований, посвященных метаболомному анализу онкологических патологий биологических тканей на основе терагерцовой лазерной спектроскопии.

Ожидаемые результаты:

— Формирование базы объектов для исследования.
—  Исследование ex-vivo оптических характеристик биологических тканей в различных поддиапазонах терагерцовой области спектра методами Time-domain спектроскопии (ТДС).
— Разработка эффективных подходов выделения информативных признаков пространственно-спектральных характеристик биологических тканей в терагерцовой области спектра.
— Разработка эффективных подходов локализации и дифференциации онкологических заболеваний кожи методами Time-domain спектроскопии в терагерцовой области спектра, технологий анализа больших данных и машинного обучения.
— Получение новых данных пространственных распределений экспериментальных спектров поглощения для парафиновых срезов биологических тканей аденокарциномы предстательной железы.

__________________________________________________________________________________

Проект

Фотосшивание коллагена в условиях оптического просветления ткани. Проект РФФИ. Соглашение № 17-32-50190 от 10.01.2018. Руководитель — Кистенев Ю.В.

Цель проекта:

Разработка физических основ лечения прогрессирующей миопии, характеризующейся растяжением склеры Установлено методами оптической когерентной томографии и терагерцовой спектроскопии существование двух стадий взаимодействия иммерсионных агентов со склерой: стадии, доминирующим процессом которой является обезвоживание ткани и стадии набухания ткани, обусловленной диффузией просветляющих веществ в ткань.

Результаты:

Получены сравнительные данные для различных иммерсионных агентов по влиянию оптического просветления на увеличение количества коллагеновых сшивок в толще склеры и данные по величине необратимого сокращения ткани склеры при сенсибилизированном УФ-фотовоздействии в различных условиях оптического просветления.

__________________________________________________________________________________

Проект

Исследование и разработка двухкаскадного параметрического генератора света с широкой перестройкой длины волны для регистрации молекулярных метаболитов в выдохе человека методом оптико-акустической спектроскопии (Бойко Андрей Александрович). Проект РФФИ. Соглашение 19-32-60055\19 от 22.08.2019. Руководитель — Кистенев Ю.В.

Цель проекта:

Исследование и создание лабораторного стенда для высокочувствительной оптико-акустической скрининговой диагностики выдоха человека для обнаружения маркеров оксидативного стресса и определения соответствующей нозологии

Ожидаемые результаты:

— Получение пороговых, энергетических и перестроечных характеристик двухкаскадного ПГС с реализацией требуемого диапазона длин волн в среднем ИК диапазоне.
— Получение расчётных данных параметров макета лазерной оптико-акустической ячейки, резонансная частота, добротность акустического резонатора, оптимальные размеры каналов.
— Разработка протоколов диагностирования молекулярных метаболитов оксидативного стресса.

__________________________________________________________________________________

Проект

Исследование ранних стадий развития лимфедемы с использованием методов биофотоники для поиска подходов к неинвазивноой диагностике данного заболевания. Проект РФФИ. Соглашение № 18-42-703012 от 09.06.2018. Руководитель — Сандыкова Е.А.

Цель проекта:

Исследование ранних стадий развития лимфедемы с использованием методов биофотоники для поиска подходов к неинвазивноой диагностике данного заболевания.

Ожидаемые результаты:

Ожидается получить достоверную зависимость изменения показателей, изучаемых при МФМ и ОКТ от степени выраженности отека и развития патологического процесса в тканях, и подтвердить это не только основываясь на антропометрическом методе исследования, но и результатами гистологического исследования (референтный метод).
Будет также проведена апробация метода оптической когерентной эластографии для исследования упругих свойств кожи при лимфедеме.

__________________________________________________________________________________

Проект

Разработка классифицирующих правил для скрининговой диагностики рака лёгких на основе анализа метаболических профилей в газовых биопробах пациентов. ФЦП ИР. Соглашение №14.578.21.0082 от 27.11.2014 Руководитель — Кистенев Ю.В.

Партнёры:

ООО «Специальные технологии» г. Новосибирск

Результаты:

Выявление наиболее специфичных спектральных характеристик (метаболический профиль или профиль спектра поглощения пробы) в выдыхаемом воздухе пациентов с основными бронхо-легочными заболеваниям и разработка на их базе классифицирущих правил для скрининговой диагностики.